Python Module Index

c | e | i | l | m | p | s | w


	c
	`seqgra.comparator`
	`seqgra.comparator.comparator`
	`seqgra.comparator.curvetablecomparator`
	`seqgra.comparator.fietablecomparator`
	`seqgra.comparator.prcomparator`
	`seqgra.comparator.roccomparator`
	`seqgra.comparator.tablecomparator`
	`seqgra.constants`

	e
	`seqgra.evaluator`
	`seqgra.evaluator.evaluator`
	`seqgra.evaluator.explainer.backprop`
	`seqgra.evaluator.explainer.deeplift`
	`seqgra.evaluator.explainer.ebp`
	`seqgra.evaluator.explainer.ebp.ebp`
	`seqgra.evaluator.explainer.ebp.functions`
	`seqgra.evaluator.explainer.feedback`
	`seqgra.evaluator.explainer.gradcam`
	`seqgra.evaluator.explainer.occlusion`
	`seqgra.evaluator.explainer.path`
	`seqgra.evaluator.explainer.patterns`
	`seqgra.evaluator.explainer.perturbation`
	`seqgra.evaluator.explainer.real_time`
	`seqgra.evaluator.explainer.real_time.pytorch_fixes`
	`seqgra.evaluator.explainer.real_time.resnet_encoder`
	`seqgra.evaluator.explainer.real_time.saliency_eval`
	`seqgra.evaluator.gradientbased`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.abstractdifferencegradientevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.abstractgradientevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.contrastiveexcitationbackpropevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.deconvevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.deepliftevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.differencegradientevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.ebphelper`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.excitationbackpropevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.feedbackevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.gradcamgradientevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.gradientbasedevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.gradientevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.gradientxinputevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.guidedbackpropevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.integratedgradientevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.nonlinearintegratedgradientevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.saliencyevaluator`
	`seqgra.evaluator.gradientbased.smoothgradevaluator`
	`seqgra.evaluator.metricsevaluator`
	`seqgra.evaluator.predictevaluator`
	`seqgra.evaluator.prevaluator`
	`seqgra.evaluator.rocevaluator`
	`seqgra.evaluator.sis`
	`seqgra.evaluator.sis.sis`
	`seqgra.evaluator.sisevaluator`

	i
	`seqgra.idresolver`

	l
	`seqgra.learner`
	`seqgra.learner.bayes`
	`seqgra.learner.bayes.bayeshelper`
	`seqgra.learner.bayes.bayeslearner`
	`seqgra.learner.dna`
	`seqgra.learner.dnahelper`
	`seqgra.learner.learner`
	`seqgra.learner.protein`
	`seqgra.learner.proteinhelper`
	`seqgra.learner.tensorflow`
	`seqgra.learner.tensorflow.kerascallback`
	`seqgra.learner.tensorflow.kerashelper`
	`seqgra.learner.tensorflow.keraslearner`
	`seqgra.learner.torch`
	`seqgra.learner.torch.torchdataset`
	`seqgra.learner.torch.torchhelper`
	`seqgra.learner.torch.torchlearner`

	m
	`seqgra.misc`
	`seqgra.model`
	`seqgra.model.data`
	`seqgra.model.data.alphabetdistribution`
	`seqgra.model.data.background`
	`seqgra.model.data.condition`
	`seqgra.model.data.datadefinition`
	`seqgra.model.data.datageneration`
	`seqgra.model.data.operation`
	`seqgra.model.data.rule`
	`seqgra.model.data.sequenceelement`
	`seqgra.model.data.spacingconstraint`
	`seqgra.model.model`
	`seqgra.model.model.architecture`
	`seqgra.model.model.modeldefinition`
	`seqgra.model.model.operation`

	p
	`seqgra.parser`
	`seqgra.parser.datadefinitionparser`
	`seqgra.parser.modeldefinitionparser`
	`seqgra.parser.xmldatadefinitionparser`
	`seqgra.parser.xmlhelper`
	`seqgra.parser.xmlmodeldefinitionparser`

	s
	`seqgra`
	`seqgra.schema`
	`seqgra.seqgra`
	`seqgra.seqgraa`
	`seqgra.seqgrae`
	`seqgra.seqgras`
	`seqgra.simulator`
	`seqgra.simulator.backgroundgenerator`
	`seqgra.simulator.example`
	`seqgra.simulator.examplegenerator`
	`seqgra.simulator.heatmap`
	`seqgra.simulator.heatmap.heatmap`
	`seqgra.simulator.motif`
	`seqgra.simulator.motif.ess`
	`seqgra.simulator.motif.kld`
	`seqgra.simulator.motif.motifinfo`
	`seqgra.simulator.simulator`

	w
	`seqgra.writer`
	`seqgra.writer.datadefinitionwriter`
	`seqgra.writer.modeldefinitionwriter`
	`seqgra.writer.xmldatadefinitionwriter`
	`seqgra.writer.xmlmodeldefinitionwriter`